医共体双向转诊存通畅
医共体双向转诊存在以下困境：医共体内从成员单位上转到牵头医院的路径相对通畅和便捷，但也存在着牵头医院住院床位紧张、一床难求的困境；从牵头医院下转到成员单位，存在着基层医院接收能力较弱的难题。
医共体基层医院资源配置不够均衡。随着政府投入不断加大，医疗体制改革不断深入，民众所能享受的医疗服务水平确实得到了显著提升，但发展不平衡不充分现象仍然严重，特别是基层医疗资源与大城市相比，差距仍然巨大。
医共体医保政策受到限制。受总额控制的限制，有些医院尤其是基层医院面临年度的指标提前用完，面临着是否继续接收患者的困境。医保在双向转诊过程中没有充分发挥出激励导向机制功能 。
医共体信息化建设不够健全。信息化建设是医共体内互联互通的重要基础。目前医共体内成员单位的信息化建设水平参差不齐、建设标准不一，数据难以整合，导致系统内信息联接的不畅通，给“上下联动，双向转诊”带来不便。软硬件的缺失也阻碍了医共体内在线会诊、远程医疗等活动的开展，造成了医共体内成员之间、医院各部门之间、医务人员与患者之间信息沟通的障碍，不利于医疗服务质量的提升。
